Lệ phí môn bài
Các tổ chức hợp tác xã cần phải nộp lệ phí môn bài theo đúng Nghị định 139/2016 NĐ-CP. Tuy nhiên, có trường hợp ngoại lệ được miễn nộp lệ phí môn bài đó là những HTX kinh doanh dịch vụ sản xuất nông nghiệp. Đây được cho là chính sách khuyến khích phát triển về mặt nông nghiệp, cây trồng, nông sản… vốn là thế mạnh kinh tế ban đầu của nước ta.
Thuế thu nhập doanh nghiệp
Hợp tác xã có nghĩa vụ chịu thuế TNDN, với mức thuế phải nộp được tính theo công thức sau:
- Thu nhập chịu thuế x thuế suất = Số tiền thuế cần phải nộp
- Trong đó: Thu nhập chịu thuế là mức thu nhập đã trừ thu nhập được miễn thuế
Ngoài ra, theo quy định của Luật thuế TNDN (năm 2008) tại Điều 14 – Khoản 4 thì sẽ có mức ưu đãi thuế suất đối với các HTX là 20%
Thuế GTGT
Về thuế suất GTGT có các mức tương ứng 0%, 5% và 10% đối với từng trường hợp cụ thể, đã được quy định tại Luật thuế GTGT. HTX có thể căn cứ vào điều luật này để biết hàng hóa/sản phẩm/dịch vụ mà mình đang sản xuất kinh doanh phải chịu mức thuế GTGT như thế nào.
Cần phải tính toán đúng mức thuế suất áp dụng đối với từng loại hình sản phẩm/hàng hóa/dịch vụ để tránh những sai sót hay vi phạm không đáng có.